Uhanalainen saimaannorpan kanta koostuu noin 400 hylkeestä, jotka elävät vain Saimaalla. Hylje tekee pesänsä lumeen Saimaan järven jäälle, jossa nopea vedenpinnan nousu tai lasku uhkaa hylkeen pesimismahdollisuuksia. Fortum säännöstelee Saimaata luonnonolosuhteita mukaillen ympäristöviranomaisten säännöstelyohjeen mukaisesti. Fortumilla on mahdollisuus poiketa säännöstelyohjeesta vähentääkseen luonnon olosuhteiden aiheuttamaa vedenpinnan nopeaa nousua tai laskua. Tätä poikkeamaa on käytetty muutaman kerran suojaamaan saimaannorpan pesintää. Viimeksi talvella 2020 poikkeamaa käytettiin rajoittamaan vedenpinnan nousua.

Fortum on kunnostanut yhteistyössä Kaakkois-Suomen ELY-keskuksen ja Imatran kaupungin kanssa virtakutuisten kalojen elinympäristöjä kalakantojen parantamiseksi. Vuonna 2013 aloitettuja kunnostuksia on tehty harjukselle ja taimenelle Tainionkosken ja Imatran voimalaitosten välillä sekä kunnostuksia on aloiteltu myös Imatran alapuoliselle osalle Suomen puolella. Kunnostuksissa ranta-alueen pohjaa muotoillaan, virtausta ohjataan sekä lisätään soraa ja kiviä.

Fortumin Imatran voimalaitoksen läheisyyteen on rakennettu keinotekoinen, 1.1 km pitkä puro, jonka tavoitteena on sekä toimia kalojen elinympäristönä että virkistyskäyttökohteena Imatran kaupungin keskellä. Vuonna 2015 avattu mahdollisimman luonnonmukaiseksi rakennettu ELY-keskuksen, Fortumin ja Imatran kaupungin yhteishanke on ylittänyt odotukset taimenten kutupaikkana, ja puron poikastiheydet ovat olleet korkeita. Kaupunkipuro tuo myös lisää kaupungin virkistyskäyttökohteisiin.

Fortum on kunnostanut yhteistyössä Kaakkois- ja Varsinais-Suomen ELY-keskusten ja Imatran kaupungin kanssa virtakutuisten kalojen elinympäristöjä kalakantojen parantamiseksi Vuoksella Imatran voimalaitoksen alapuolella. Kunnostuksessa Kokkasaari purettiin, pohjaa muotoiltiin, virtausta ohjattiin sekä lisättiin soraa ja kiviä.