Koitere-järveen liittyen toteutettiin vuosina 2004-2006 yhteistyöhanke, jonka tuloksena määritettiin useita Koitere-järven säännöstelyä koskevia suosituksia. Suositukset määrittävät tavoitteelliset vedenkorkeudet eri vuodenaikoina ja ovat selvästi voimassa olevia lupia tiukemmat. Suositusten mukainen säännöstely ottaa aikaisempaa paremmin huomioon järven vesiluonnon (esim. kuikka, kalakannat, rantavyöhyke) sekä virkistyskäytön (veneily, maisema). Vattenfall Oy on vapaaehtoisesti säännöstellyt Koiteretta ottaen suositukset huomioon vuodesta 2007 lähtien. Suositusten toteutumista seurataan vuosittain paikallisten yhteistyötahojen kanssa.

Lieksanjoella Pankakosken voimalaitoksella on vuonna 2021 otettu käyttöön vaelluspoikasten kiinniottolaite, josta poikaset voidaan siirtää suoraan Pieliseen. Hankkeen kehitystyö jatkuu edelleen.

Lieksanjoella on tehty järvilohi- ja taimenkannan luontaisen lisääntymisen edistämiseksi pienpoikasistutuksia, emokalojen ylisiirtoja sekä kutu- ja poikastuotantoalueiden kunnostuksia mm. helikopterisoraistuksilla. Toimintaa ohjaa Lieksanjoen vaelluskalatyöryhmä.